Studien kombinieren Gentests und elektronische Patientenakten, um nicht diagnostizierte Krankheiten zu finden | VUMC-Reporter

Studien von Andrew Glazer, PhD, Giovanni Davogustto, MD, und Kollegen haben ergeben, dass Gentests mit Informationen aus elektronischen Patientenakten nicht diagnostizierte Herzrhythmusstörungen aufdecken können.
Studien von Andrew Glazer, PhD, Giovanni Davogustto, MD, und Kollegen haben ergeben, dass Gentests mit Informationen aus elektronischen Patientenakten nicht diagnostizierte Herzrhythmusstörungen aufdecken können. (Foto von Donn Jones)

von Leigh MacMillan

Die Kombination von Gentests mit Informationen aus elektronischen Patientenakten kann laut zweier neuerer Studien nicht diagnostizierte Herzrhythmusstörungen und neue Erkrankungen im Zusammenhang mit vererbten Krebsgenmutationen aufdecken.

Die Ergebnisse unterstützen die zunehmende Verwendung genetischer Informationen in der klinischen Versorgung, sagte er Dan RodenMD, Senior Vice President for Personalized Medicine am Vanderbilt University Medical Center und Seniorautor der in der Zeitschrift veröffentlichten Arrhythmie-Studie Verkehr.

Die neuen Berichte stützen sich auf Daten aus dem auftauchen (Electronic Medical Records and Genomics)-Netzwerk, ein nationales Konsortium, das vom National Human Genome Research Institute, Teil der National Institutes of Health, organisiert und unterstützt wird. VUMC dient seit dem Start von eMERGE im Jahr 2007 sowohl als Netzwerkstandort als auch als nationales Koordinierungszentrum.

Für die neuesten Studien rekrutierte eMERGE fast 25.000 Personen an 10 Netzwerkstandorten und sequenzierte ein benutzerdefiniertes Panel von 109 Genen. Das Ziel, sagte Roden, sei es, Menschen mit unerkannten Mendelschen Krankheiten (Krankheiten, die aus der Mutation eines einzelnen Gens resultieren) zu identifizieren und ihnen diese Informationen zurückzugeben.

Insgesamt stellte das Konsortium fest, dass etwa 3 % der Teilnehmer eine krankheitsassoziierte pathogene oder wahrscheinlich pathogene (P/LP) Variante in einem der Gene aufwiesen.

Jetzt im Verkehr Studie geleitet von Andreas GlaserPromotion und Giovanni DavogustoMD, am VUMC untersuchten die Forscher 10 der Gene, die mit Herzrhythmusstörungen in Verbindung gebracht werden.

„Die Fragen, die wir stellten, waren: Wie viele Menschen – die keine vorherige Indikation für kardiologische Gentests hatten – hatten pathogene oder wahrscheinlich pathogene Varianten; und wie viele dieser Personen hatten tatsächlich einen Phänotyp in den elektronischen Patientenakten?“ sagte Roden.

Unter 21.846 Teilnehmern fanden sie heraus, dass 120 (0,6 %) P/LP-Varianten in den Arrhythmie-assoziierten Genen aufwiesen. Bei der Analyse elektronischer Patientenakten fanden sie einen höheren Prozentsatz an Arrhythmie-Phänotypen bei Personen mit P/LP-Varianten im Vergleich zu denen ohne die Varianten.

Das Team konnte die Ergebnisse an 54 Teilnehmer zurückgeben und mit klinischer Nachsorge 19 Diagnosen von erblichen Arrhythmie-Syndromen stellen.

Zusätzlich zu den P/LP-Varianten fanden die Forscher heraus, dass 1.838 Personen (8,4 %) „Varianten unsicherer Signifikanz“ (VUS) in einem Arrhythmie-assoziierten Gen aufwiesen. VUSs stellen eine Herausforderung für die Genommedizin dar, sagte Roden, da ihr Beitrag zu Krankheiten unbekannt ist.

Insgesamt hatten VUS-Träger im Vergleich zu Nicht-Trägern nicht mehr Arrhythmie-Phänotypen in elektronischen Patientenakten, aber 116 VUS traten bei mindestens einem Teilnehmer mit einem Arrhythmie-Phänotyp auf. Die Forscher wählten 50 dieser VUSs aus, um sie in vitro unter Verwendung von Hochdurchsatz-Patch-Clamp-Elektrophysiologie zu untersuchen (um die Auswirkungen der Variante auf die Proteinfunktion zu bewerten). Sie konnten 11 Varianten neu klassifizieren: drei als wahrscheinlich gutartig und acht als P/LP.

Eine weitere Studie, veröffentlicht in JAMA Onkologie und unter der Leitung von Chenjie Zeng, PhD, MPH, und Joshua Denny, MD, am NHGRI, untersuchten das Spektrum der mit erblichen Krebssyndromen verbundenen Krankheiten unter Verwendung von Daten aus eMERGE und zwei anderen großen Kohorten.

Die Forscher, darunter Lisa BastaracheFRAU, Georg Wiesner, MD, und andere bei VUMC, führten eine phänomenweite Assoziationsstudie durch, um Phänotypen elektronischer Krankenakten zu finden, die mit P/LP-Varianten in 23 erblichen Krebsgenen assoziiert sind. Zusätzlich zur Replikation etablierter Gen-Krebs-Assoziationen identifizierten sie 19 neue Assoziationen: sieben für verschiedene Krebsarten und 12 für Erkrankungen wie Ovarialzysten, akute Pankreatitis und chronische Gastritis. Die Ergebnisse könnten die Früherkennung und ein besseres Management von Krebserkrankungen erleichtern, stellten die Forscher fest.

„Die Take-Home-Message ist, dass 3 % der Menschen eine pathogene oder wahrscheinlich pathogene Variante in einem krankheitsverursachenden Gen tragen werden und viele andere Varianten von ungewisser Bedeutung tragen werden“, sagte Roden. „Wir können Gentests, Phänotypen elektronischer Krankenakten und In-vitro-Technologien verwenden, um Menschen mit unerkannten genetischen Krankheiten zu bewerten und zu finden und durch frühere Diagnosen Leben zu retten.“

Roden, Inhaber des Sam L. Clark, MD, PhD Stiftungslehrstuhls, ist Professor für Medizin, Pharmakologie und biomedizinische Informatik und Direktor des John A. Oates Institute for Experimental Therapeutics. Glazer ist Assistenzprofessor für Medizin und Davogustto ist Dozent für Medizin. Die Forschung wurde durch Zuschüsse des NIH und der American Heart Association unterstützt.

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